تدور أحداث لعبة Star Wars Jedi: Fallen Order بعد خمس سنوات من نهاية Clone Wars، في الفترة الزمنية التي تقع بين الأفلام الثلاثية السابقة والأفلام الثلاثية الأصلية. كان Cal Kestis، وهو بادوان سابق، يعيش مختبئًا بعد هروبه من مذبحة Order 66 التي استهدفت Jedi. كان يعمل كعامل ميكانيكي في تفكيك السفن لصالح الإمبراطورية على كوكب Bracca، حيث كان يخفي هويته الحقيقية وقدراته. ولكن بعد أن اضطر لاستخدام قواه في Force لإنقاذ صديقه Prauf من حادث خطير أثناء العمل، يتم اكتشاف وجوده من قبل Inquisitors، وهم عملاء للإمبراطورية تم تدريبهم على مطاردة وتصفية Jedi المتبقين.
بعد اكتشافه، يجد Cal نفسه في سباق ضد الإمبراطورية وملاحقيها، Inquisitors، في محاولة للعثور على codex يحتوي على قائمة بالأطفال الذين يمتلكون قدرات خاصة وحساسية للقوة عبر المجرة.
The Inquisitors و The Mantis و And Eno Cordova
بعد أن أنقذ Bracca من السقوط المميت باستخدام قوة Force، تم اكتشاف Cal تقريبًا فورًا من قبل اثنين من Inquisitors: The Second Sister و The Ninth Sister. هؤلاء Inquisitors، الذين تم تدريبهم من قبل Darth Vader نفسه، هم مستخدمو القوة الذين تم تكليفهم بتعقب أي Jedi قد نجا من Order 66. Cal يتمكن من مواجهة Inquisitors وفرقة Stormtroopers التي ترافقهم، وفي النهاية يتم إنقاذه بواسطة Cere Junda و Greez Dritus على متن السفينة The Mantis. Cere هي Jedi سابقة في مهمة لاستعادة Jedi Holocron، وهو جهاز تم إنشاؤه بواسطة معلمها Eno Cordova.
الـ Holocron، الذي يمكن قراءته فقط من قبل الأشخاص الحساسين للقوة، تم إنشاؤه بواسطة Eno Cordova بعد أن حصل على رؤية حول سقوط Jedi. قام بإنشاء قائمة رئيسية تضم جميع الأطفال الحساسين للقوة، ومن أجل حمايتهم، قام بإخفاءها في خزينة على كوكب Bogano. Cere تعتقد أن استعادة هذا الـ Holocron هو المفتاح لإعادة إحياء نظام Jedi وفي يوم ما هزيمة الإمبراطورية. Cere تحتاج إلى مساعدة Cal في هذا الأمر، لأنها قد أغلقت نفسها تمامًا عن القوة. تأخذه إلى Bogano للبحث عن أدلة حول كيفية الحصول على الـ Holocron. هناك، يلتقي Cal بالروبوت المخلص لـ Cordova، BD-1، الذي يحتوي على رسائل من Cordova. رسالته الأولى تقود الفريق إلى Zeffo، كوكب موطن صناع الخزينة.
Zeffo، Kashyyyk والهوية الحقيقية لـ Second Sister
هناك، يُواجه Cal مرة أخرى The Second Sister التي تكشف عن نفسها بأنها Trilla، با_PADAWAN السابقة لـ Cere. خلال حروب الاستنساخ، تركت Cere Trilla مع مجموعة من الشبان، وتم القبض على Trilla بواسطة الإمبراطورية، حيث تعرضت للتعذيب وتحولت إلى The Second Sister الانتقامية. ينجح Cal في الهروب بصعوبة من Trilla، لكنه يُقبض عليه من قبل صائد جوائز ويُضطر للقتال في ساحة مصارعة. يتم إنقاذه بواسطة طاقم The Mantis، وبالصدفة، يتلقى اتصالًا يفيد بأنه تم تحديد مكان Tarfull. يعود الطاقم إلى Kashyyk للقاء Tarfull.
The Origin Tree وأخوات Dathomir و Taron Malicos
يخبر Tarfull Cal أن يبحث عن إجابات في The Origin Tree في Shadowlands الخطيرة على Kashyyk. هناك، يجد Cal تسجيلًا لـ Cordova يوضح أن المفتاح، المعروف باسم Astrium، يمكن العثور عليه على كوكب يُدعى Dathomir. قبل أن يتمكن من الهروب من Shadowlands، يتعين على Cal محاربة وقتل The Ninth Sister.
في Dathomir، يتم اعتراض Cal من قبل Nightsister Marrin، وهي مستخدمة سحر تلوم Jedi على الإبادة الجماعية لشعبها خلال Clone Wars. لقد قام Taron Malicos، وهو Jedi سابق آخر، بتلاعب Nightsisters ضد Jedi من أجل استغلال قوتهم السحرية.قبل أن يتمكن Cal من حل مشكلات Marrin، يواجه مشكلاته الخاصة.